Battle Clashの出来事で阻止されてから3年後、Anubisと彼の幹部たちはかつて支配した地球を取り戻すために帰還する。パイロットのMike Andersonとプレイヤー(ガンナーとして)がチームワークを発揮し、強化されたStanding Tank(ST)FALCONに乗り込んで、一連の一対一・一人称視点のメックバトルで反撃し、星間規模の陰謀を解き明かすことになる。GuidoやCarlosをはじめ、前作でおなじみの敵キャラクターが再登場するが、新たな悪役たちのほとんどはまったく新しい挑戦をプレイヤーに突きつける。ありがたいことに、無制限のコンティニューとパイロットからのアドバイスが苦しい場面での攻略をサポートしてくれるほか、敵STの弱点を露わにする強力な一撃・Treble Energy Boltも頼もしい味方だ。