チクタク!Bowserが歴史を混乱させるために過去から15個の伝説的なアイテムを盗み出してしまった。Marioはそれぞれを正しい時代と持ち主のもとへ返すことで、歴史を正しい軌道に戻さなければならない。ゲームはBowserのミュージアムからスタートし、そこには台座の上にIsaac Newtonのリンゴやmichelangeloのノミなど、盗まれた歴史的に重要なアイテムが展示されている。アイテムを手に取ると「歴史のページ」を開くことができ、その年代・場所・関連する人物についての解説が表示される。この解説には最大14箇所の空欄があり、複数選択式のリストから埋めていく必要があるが、Joan of Arcの軍の規模やGandhiがいつインドに戻ったかをどうやって知ればいいのだろうか?そこで活躍するのが、BowserのタイムマシンであるTimulatorだ。適切な年代と場所をダイヤルで設定すると、「タイムサーフィン」ミニゲームが始まり、ポータルに入る前に10個のキノコを集め、機雷を回避しなければならない。