Dans ce jeu de combat en tête-à-tête, les joueurs prennent le contrôle de l'un des quatre Ninja Turtles (Leonardo, Michelangelo, Donatello, ou Raphael) dans le mode histoire et doivent vaincre les trois autres avant d'affronter Casey Jones, Hot Head, et enfin le maléfique Shredder. Le gameplay se déroule sur un plan horizontal unique, les joueurs pouvant se déplacer vers l'avant et vers l'arrière, sauter, s'accroupir, attaquer et bloquer.