Neste jogo de luta um contra um, os jogadores assumem o controle de uma das quatro Tartarugas Ninja (Leonardo, Michelangelo, Donatello ou Raphael) no modo história e precisam derrotar as outras três antes de enfrentar Casey Jones, Hot Head e, por fim, o maligno Shredder. A jogabilidade acontece em um único plano horizontal, com os jogadores podendo se mover para frente e para trás, pular, agachar, atacar e defender.