Neste jogo de estratégia/luta, invasores alienígenas estão controlando monstros para dominar o Japão, e Godzilla é o único que pode detê-los. Os monstros manipulados são alguns dos arqui-inimigos mais duros de Godzilla, incluindo King Ghidorah, Mechagodzilla, Biollante, Battra e Mecha-King Ghidorah. Há dois modos de jogabilidade ao longo da experiência – movimento e batalha.