このゲームの3つのモードでクッキーを消す方法は食べることではなく、揃えることだ!100のアクションステージでは、プレイフィールドに行と列で並んだクッキーが与えられる。カーソルでクッキーを選択すると、その列全体を水平または垂直にスライドでき、クッキーははみ出すと反対側から現れる仕組みだ。行や列を同じ種類(Check、Circle、Diamond、Flower、またはHeart)に揃えると消すことができ、同じ種類の5列を消せばワイルドカードのYoshi cookieが手に入る。上と右から新しいクッキーが次々と出現するため、素早く全てのクッキーを消さなければならない。端まで達するとゲームオーバーだ。よりじっくり楽しみたいなら、Alexey Pajitnovがデザインしたパズルステージに挑戦しよう。限られた手数で画面上のクッキーを全て消すことが目標となる。