Préchauffez vos régulateurs de combustion polytroniques et secourez Spot des griffes du maléfique Trash Alien ! Galactic Commander envoie le joueur, dans la peau de Blasternaut, nettoyer les déchets du secteur environnant, traquer le Trash Alien, détruire son vaisseau et sauver Spot. Pour ce faire, le joueur doit parcourir trois modes de jeu (un quatrième, Number Recycler, n'a pas survécu au portage de la version PC vers la Super Nintendo).