Pour retrouver sa petite amie rencontrée par hasard, B.O.B., le jeune androïde, doit combattre à travers 50 niveaux en side-scrolling répartis sur trois planètes périlleuses. Chacune offre des paysages uniques, comme les cavernes à carapace de Goth, les temples maléfiques d'Anciena, et les blobs gélatineux d'Ultraworld, et tous sont truffés d'ennemis, notamment des robots, des méduses volantes et des insectes excréteurs.