Inspiré librement du jeu d'arcade, le joueur contrôle Indiana Jones avec son fidèle fouet dans des cavernes souterraines où il doit sauver tous les enfants de chaque niveau, appelé une « vague ». Chaque vague se compose d'au moins une salle qu'Indy peut explorer pour sauver des enfants et collecter des objets, notamment d'autres armes (bombe, pistolet et épée), que l'on peut maladroitement sélectionner en utilisant SELECT et le D-pad.